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dc.contributor.author付达
dc.contributor.author陈友兵
dc.contributor.author卓之豪
dc.contributor.author闵小平
dc.contributor.author王海
dc.contributor.author葛胜祥
dc.contributor.author张师音
dc.contributor.author王进
dc.date.accessioned2020-10-10T03:15:06Z
dc.date.available2020-10-10T03:15:06Z
dc.date.issued2019-05-28
dc.identifier.citation生物医学工程学杂志,2019,36(03):414-420
dc.identifier.issn1001-5515
dc.identifier.urihttps://dspace.xmu.edu.cn/handle/2288/177636
dc.description.abstract热对流聚合酶连锁反应(CCPCR)利用热对流的原理,让试剂在试管内流动,通过试管上下部分的温度差来达到扩增目的。为了实时检测扩增效果,我们在试剂体系中加入了荧光基团,通过荧光的强弱实时反映扩增的情况。实验结果显示荧光变化曲线符合扩增曲线的S型趋势,但是由于热对流的不稳定性而存在一定的抖动情况,不利于扩增循环阈值(CT值)的计算。为了解决这个问题,本文采用动力学方法,利用双S型函数模型来拟合曲线,使荧光曲线平滑,从而能更好地根据曲线来推断核酸初始浓度,达到定量的目的。同时采用PSO+算法求解双S型函数参数,即用粒子群优化(PSO)算法结合Levenberg-Marquardt、Newton-CG等算法进行曲线拟合,有效克服PSO随机性太强和传统算法Levenberg-Marquardt、Newton-CG等容易陷入局部最优解的缺点,数据拟合结果的R~2能够达到0.999 8。此研究对以后的实时荧光热对流扩增的定量检测研究有指导性意义。
dc.description.sponsorship国家自然科学基金(81871505);;\n福建省自然科学基金(2017J05136);;\n国家重点实验室自主课题资助项目(2018ZY001)
dc.language.isozh_CN
dc.subject热对流聚合酶连锁反应
dc.subject曲线拟合
dc.subject双S型函数
dc.subject粒子群
dc.titlePSO+:基于粒子群结合其他迭代算法非线性拟合热对流聚合酶连锁反应的荧光数据
dc.typeArticle


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